A história desenrola-se no Colégio de Educação Avançada, onde 100% dos alunos vão para a universidade ou arranjam emprego. Os alunos têm a liberdade de usar qualquer penteado e trazer qualquer tipo de adereço pessoal. O Colégio de Educação Avançada parece um paraíso de uma escola, mas a verdade é que apenas os alunos superiores recebem tratamento preferencial. O protagonista, Kiyotaka Ayanokouji, é um estudante da Classe D, que é onde a escola despeja os seus alunos “inferiores” para os ridicularizar. Por uma certa razão, Kiyotaka foi negligente no seu exame de admissão e foi colocado na classe D. Após conhecer Suzune Horikita e Kikyou Kushida, duas outras estudantes da sua classe, a situação de Kiyotaka começa a mudar.